Une r\u00e9cente \u00e9tude publi\u00e9e dans la revue Nature rapporte qu\u2019un nouvel ensemble de g\u00e8nes et leurs prot\u00e9ines ont des effets importants sur le niveau d\u2019immunoglobuline E (IgE), les allergies et l\u2019asthme.<\/p>\n
Cette \u00e9tude a \u00e9t\u00e9 r\u00e9alis\u00e9e par une \u00e9quipe de 18 chercheurs du Canada, du Royaume-Uni et des \u00c9tats-Unis. Deuxi\u00e8me auteure en importance, Catherine Laprise, professeure-chercheuse au D\u00e9partement des sciences fondamentales de l\u2019UQAC et titulaire de la Chaire de recherche du Canada sur l\u2019\u00e9tude des d\u00e9terminants g\u00e9n\u00e9tiques de l\u2019asthme, a dirig\u00e9 l\u2019\u00e9tude familiale Saguenay-Lac-Saint-Jean qui a servi \u00e0 identifier les g\u00e8nes et \u00e0 confirmer que les observations \u00e9taient bien reli\u00e9es \u00e0 l\u2019activit\u00e9 d\u2019une cellule pr\u00e9cise\u00a0: les \u00e9osinophiles.<\/p>\n
En effet, pour valider leurs r\u00e9sultats positifs, les chercheurs ont \u00e9valu\u00e9 si ces r\u00e9sultats pouvaient \u00eatre confirm\u00e9s dans les familles avec des niveaux extr\u00eames (tr\u00e8s \u00e9lev\u00e9s et tr\u00e8s bas) d\u2019IgE \u00e0 partir d\u2019individus du Pays de Galles et de familles asthmatiques du Qu\u00e9bec (\u00e9tude familiale Saguenay-Lac-Saint-Jean (SLSJ) dirig\u00e9e par la Dre Catherine Laprise, professeure de l\u2019UQAC).<\/p>\n
Ils ont trouv\u00e9 de fortes associations entre les IgE et des \u00eelots de m\u00e9thylation \u00e0 36 endroits dans 34 g\u00e8nes diff\u00e9rents. Plusieurs de ces g\u00e8nes \u00e9taient connus pour \u00eatre impliqu\u00e9s dans l\u2019activit\u00e9 biologique des \u00e9osinophiles. Sous la direction de la Dre Laprise, on a donc s\u00e9par\u00e9 les \u00e9osinophiles \u00e0 partir d\u2019\u00e9chantillons sanguins de 24 individus provenant de la cohorte familiale SLSJ et d\u00e9montr\u00e9 que, pour les 34 g\u00e8nes, les effets les plus marqu\u00e9s se retrouvent chez les personnes asthmatiques avec des niveaux \u00e9lev\u00e9s d\u2019IgE.<\/p>\n
R\u00e9sultats de l\u2019\u00e9tude Des th\u00e9rapies qui neutralisent les \u00e9osinophiles existent d\u00e9j\u00e0, mais elles sont tr\u00e8s co\u00fbteuses et elles sont efficaces seulement chez un certain nombre d\u2019asthmatiques. Les nouveaux g\u00e8nes d\u2019activation identifi\u00e9s dans cette \u00e9tude fournissent des pistes possibles de traitements cibl\u00e9s qui pourraient permettre de pr\u00e9dire qui r\u00e9pondra au traitement avant de commencer la th\u00e9rapie.<\/p>\n L\u2019\u00e9quipe de recherche a utilis\u00e9 une nouvelle technique pour d\u00e9couvrir ces g\u00e8nes, connus sous le nom d\u2019\u00a0\u00ab\u00a0\u00e9tude d\u2019association \u00e9pig\u00e9nomique\u00a0\u00bb (EWAS). Les modifications \u00e9pig\u00e9n\u00e9tiques de l\u2019ADN ne modifient pas la s\u00e9quence d\u2019ADN ou le code g\u00e9n\u00e9tique, mais elles peuvent \u00eatre transmises \u00e0 la descendance. Ainsi, elles conduisent les cellules \u00e0 produire des prot\u00e9ines sp\u00e9cifiques et \u00e0 former des tissus sp\u00e9cialis\u00e9s.<\/p>\n Les changements \u00e9pig\u00e9n\u00e9tiques consid\u00e9r\u00e9s dans cette \u00e9tude sont en fait des modifications dans les mol\u00e9cules d\u2019ADN par l\u2019attache de groupements m\u00e9thyles sur le c\u00f4t\u00e9 de la cha\u00eene d\u2019ADN, pr\u00e9cis\u00e9ment au niveau de certaines bases nucl\u00e9otidiques, principalement les cytosines. Ces m\u00e9thyles sont des mol\u00e9cules qui peuvent, selon leur nombre et leur position sur l\u2019ADN, r\u00e9guler un g\u00e8ne \u00e0 la hausse ou \u00e0 la baisse. Les chercheurs ont consid\u00e9r\u00e9 27\u00a0000 r\u00e9gions hautement susceptibles (\u00ab\u00a0hotspots\u00a0\u00bb) d\u2019\u00eatre m\u00e9thyl\u00e9es, appel\u00e9es \u00eelots CpG, qui sont positionn\u00e9s \u00e0 proximit\u00e9 de nombreux g\u00e8nes. Ils ont d\u2019abord \u00e9valu\u00e9 si les niveaux de m\u00e9thylation dans ces \u00eelots de globules blancs \u00e9taient corr\u00e9l\u00e9s avec le niveau d\u2019IgE dans le sang provenant de familles asthmatiques du Royaume-Uni et valid\u00e9 les observations dans la cohorte de la Dre Laprise.<\/p>\n Cette \u00e9tude d\u00e9montre l\u2019importance d\u2019\u00e9tudier l\u2019\u00e9pig\u00e9nome pour mieux comprendre les maladies fr\u00e9quentes comme l\u2019asthme et l\u2019allergie. En effet, les \u00e9tudes g\u00e9n\u00e9tiques (qui repr\u00e9sentent l\u2019\u00e9tude des modifications des s\u00e9quences d\u2019ADN) r\u00e9alis\u00e9es pour identifier les g\u00e8nes responsables des hauts taux d\u2019IgE avaient permis d\u2019expliquer seulement 1% des diff\u00e9rences interindividuelles de ces taux et n\u2019ont pas permis de d\u00e9couvrir de nouvelles cibles th\u00e9rapeutiques ou de documenter les voies biologiques qui contr\u00f4lent ces niveaux d\u2019IgE. En contrepartie, les associations \u00e9pig\u00e9n\u00e9tiques d\u00e9couvertes dans la pr\u00e9sente \u00e9tude permettent d\u2019expliquer 13% de la variation des taux d\u2019IgE ce qui est 10 fois plus que ce qu\u2019a permis la g\u00e9n\u00e9tique traditionnelle.<\/p>\n L\u2019avantage des \u00e9tudes \u00e9pig\u00e9n\u00e9tiques par rapport aux \u00e9tudes g\u00e9n\u00e9tiques r\u00e9side principalement dans le fait qu\u2019elles consid\u00e8rent des param\u00e8tres comme le vieillissement et le sexe des individus. Les chercheurs ont d\u00fb utiliser des techniques statistiques avanc\u00e9es pour s\u2019assurer de la validit\u00e9 des r\u00e9sultats obtenus en plus de confirmer dans diverses cohortes ind\u00e9pendantes.<\/p>\n L\u2019\u00e9tude a \u00e9t\u00e9 principalement financ\u00e9e par le Freemasons\u2019 Grand Charity et le Wellcome Trust de Londres ainsi que par G\u00e9nome Qu\u00e9bec. L\u2019\u00e9tude familiale SLSJ a \u00e9t\u00e9 soutenue par la Chaire de recherche du Canada dirig\u00e9e par la Dre Catherine Laprise et les subventions des Instituts de recherche en sant\u00e9 du Canada d\u00e9tenues par cette m\u00eame chercheuse.<\/p>\n <\/p>\n
\n<\/strong>Parmi les g\u00e8nes identifi\u00e9s, certains repr\u00e9sentent de nouvelles cibles th\u00e9rapeutiques prometteuses pour le traitement des allergies et de l\u2019asthme. Les chercheurs ont \u00e9galement constat\u00e9 que les produits de ces g\u00e8nes sont concentr\u00e9s dans les \u00e9osinophiles, un type de globule blanc qui s\u2019active lors de l\u2019inflammation dans les voies respiratoires de personnes asthmatiques. Les g\u00e8nes sont particuli\u00e8rement li\u00e9s \u00e0 l\u2019activation des \u00e9osinophiles, les pla\u00e7ant dans un \u00e9tat qui cause des d\u00e9g\u00e2ts dans les bronches et les poumons.<\/p>\n